2020年刺突糖蛋白与人体细胞结合的计算区分_病毒安全_

英国变种，也称为B. 1. 1. 7，最早于2020年9月被发山分校的Chimera软件和德克萨斯高级计算中心的Frontera超级计算机进行分子动力学模拟的。”

Padilla-Sanchez发现，英国的COVID-19变体在棘突糖蛋白中有许多突变，但最重要的是与ACE2受体相互作用的受体结合域中的N501Y突变。

“这种N501Y突变提供了更高的结合效率，使该病毒更具感染性。该变种正在取代英国以前的病毒，并正在世界许多其他地区传播。”

南非变种出现在2020年10月，其尖峰糖蛋白发生了更重要的变化，使其比英国变种更危险。它涉及一个称为E484K的关键突变，该突变可帮助病毒逃避抗体，并根据先前的感染或疫苗经验，可以与新的冠状病毒抗衡的免疫系统的一部分。由于此变种规避免疫力，因此人体将无法抵抗病毒。他说：“我们开始在美国看到南非的变种。”

帕迪拉-桑切斯（Padilla-Sanchez）进行了结构分析，研究了该病毒的晶体结构；和分子动力学来获得这些发现。 “在进行这项研究时，主要的计算挑战是找到一台功能强大的计算机来执行分子动力学任务，这将产生非常大的文件并需要大量的内存。没有Frontera超级计算机，这项研究是不可能完成的。”帕迪拉·桑切斯说。

根据帕迪拉-桑切斯的说法，当前的疫苗不一定能治疗变种。 “该变体将需要自己的特定疫苗。我们将需要尽可能多的疫苗来治疗出现的变体。”

展望未来，帕迪拉-桑切斯（Padilla-Sanchez）将继续研究SARS-CoV-2的变化。他说：“这是一个持续了一个月的非常快速的项目计算研究。” “有许多其他实验室在进行湿实验室实验，但没有进行太多的计算研究。这就是为什么我决定现在进行这项重要工作的原因。”

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